名島城はもと大友の根拠地で、立花城の出城であった。天正１５年（１５８７）豊臣秀吉は島津征伐の後、小早川隆景を筑前国主に封じ、この城を増強するとともに「御座所」を設けさせ、何か事がおこった場合に備えるとともに、九州監察の中心とした。文禄の役の折に秀吉は肥前名護屋への西下の途中、淀君らとこの城に立寄って宿泊をしている。

この城は関が原合戦後、慶長５年（１６００）黒田長政が筑前国主となり、やがて福崎の地に新しく福岡城を築いたので、廃城となったが、城跡らしさがまだ残っている。山腹の名島神社は宗像三女神を祭神とし、元来神宮が峰に祀られていたのを隆景が築城する時、現在地に移したものである。なお、神社の本地仏である弁財天は、この地宗栄寺に移されている。

慶長５年（１６００）の関ヶ原の戦いで、西軍に属しながら離反して東軍についた小早川秀秋は、関ヶ原直前の慶長４年（１５９９）本城の城主となりました。戦後の論功行賞では岡山藩５５万石に加増・移封されますが２年後に早世し、その死後小早川家は徳川政権初の無嗣改易（むしかいえき）となりました。

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応神天皇を主祭神とし、神功皇后と玉依姫命を配祀する。大分県宇佐市の宇佐神宮、京都府八幡市の石清水八幡宮とともに日本三大八幡宮の一つとされる。博多区住吉の住吉神社とともに筑前国一宮とされる。「はこ」の字は円筒状の容器を意味する「筥」が正字であり「箱」ではない。ただし同宮が在する地名・駅名などは筥崎宮の「筥崎」では筥崎八幡神に対して恐れ多いという理由から「箱崎」と表記する。
元寇の際、蒙古軍を撃退したとされる神風は、当社の神徳であると言われている。